在300多年后的未来世界，人类已经熟练掌握了太空旅行技术并且开发太空资源。人类在宇宙中建立了许多殖民星球，而殖民防卫军（Colonial Defense Force 简称CDF）就是负责保卫地球殖民地的军队，维护殖民地的和平，抵御外来未知入侵都是他们的任务。
　　在2368年3月1日，在遥远的Icarus地区的殖民地与地球失去了联系，2天后，所属于殖民防卫军的无畏级宇宙飞船巨人号奉命前去调查失联原因。巨人号的船员调查Icarus 3号空间站，并且做一些维修工作。
　　我们的故事由此展开，九天之后，殖民防卫军的巨人号飞船成了一艘幽灵船，这究竟是怎么回事？玩家需要做的，就是解开这个谜团。